深圳市第二人民医院眼科是院重点学科，是广东省低视力康复技术指导中心深圳基地及卫生部“视觉第一中国行动”深圳培训基地。包括两个门诊、一个病区、一个准分子激光治疗中心。现有医护人员38人，其中主任医师3人，副主任医师4人，硕士生导师1人，科室拥有一批先进的诊疗设备，如Technolas217z准分子激光屈光矫正系统、AlconInfinity超声乳化仪、博士伦前后段玻切机、OrbscanII眼前段综合分析诊断系统、德国罗兰多焦电生理系统、Zeiss免散瞳眼底荧光血管造影仪、YAG激光治疗仪、Topcon综合验光仪、Topcon眼前段成像系统、Humphrey视野计、Zeiss角膜内皮细胞检测仪、Topcon3D－OCT、Topcon非接触眼压仪等。眼科在复杂性眼外伤的诊治、白内障的手术治疗、角膜屈光手术、视网膜脱离、玻璃体手术方面有丰富的临床经验。年诊治患者6万余人次，手术量年3000余例（含眼科激光手术），承担着深圳市的眼科临床、教学、科研以及急诊急救任务，已成为在深圳市乃至广东省具有一定影响力的综合性眼科。