确诊结肠炎之后应该注意系统治疗，包括一般治疗，注意不能劳累，合理的膳食，远离刺激性的食品，要多吃富含热量的蛋白质类食物。也应该进行药物治疗，包括应用 免疫抑制剂以及氨基水杨酸制剂，能够缓解病情。
在治疗期间也应该定期观察腹部的症状与体征，定期进行结肠镜的检查，如果 溃疡性结肠炎并发中毒性的结肠扩张或者出现穿孔，这种情况下需要进行手术治疗。
结肠炎最常见是溃疡性结肠炎，与自身免疫和遗传因素有关，常伴有自身免疫的肠外表现，肾上腺糖皮质激素治疗能够使本病缓解血清中能够检查出抗结肠上皮细胞抗体，可能自身抗体与自身结肠上皮细胞抗原免疫反应，从而引起结肠粘膜损伤和炎症。主要在中青年患者人群发病率比较高。典型的表现是腹痛、腹胀、腹泻，并且有粘液脓血便，严重的还会影响到病人的生活以及工作。