甲状腺癌的治疗是以手术治疗为主，对于分化型甲状腺癌，可以辅助 内分泌治疗和 放射性碘的治疗。
手术的治疗主要包括甲状腺腺体的切除和周围淋巴结的清扫。甲状腺体最小的切除范围是一侧腺液和峡部的切除，必要时做全甲状腺的切除。手术方式的选择可以经颈部的切除，也可以做腔镜手术。
分化型甲状腺癌还可以辅助内分泌的治疗。对于乳头状癌和滤泡状癌，如果患者病情严重术后还可以进行碘131的治疗。另外对分化型甲状腺癌，可以进行外照射的治疗。对一些晚期的甲状腺癌患者，还可以进行靶向药物的治疗。