脊髓纵裂的治疗与脊髓纵裂的具体情况相关联。如果患者没有骨性分隔，现在医学界一般认为不需要治疗。如果患者存在骨性分隔的情况，因为 骨刺会对脊髓的发育产生相关的影响，会对脊髓有切割和压迫的作用，就会引起一系列的神经功能障碍。所以患者一旦出现骨性分隔的情况，就应该尽早地进行 手术治疗，来切掉骨性分隔，以避免对身体产生更加严重的影响。
脊髓纵裂的治疗方式包括两个部分：
第一，纵隔切除，根据影像学定位，来进行纵隔切除；
第二，处理并存的问题，如紧张终丝的切断、 畸胎瘤的切除等问题。
在手术过程中，切掉骨性分隔，同时也要切掉脊髓之间的纤维分隔，将两个脊髓合在一个硬膜囊内，也就是合二为一，这样的手术才是整个手术的过程。