孕酮低的原因有可能是黄体功能不全，卵巢黄体发育不全时，孕酮含量相应降低，孕酮就相对于正常健康的女士来说会比较低。也可能是 肾上腺、 甲状腺功能严重失调，这样，也会产生一定的病理性身体，影响卵巢功能，导致受孕受到阻碍和影响，使排卵发生障碍，孕酮含量也会相应降低，相对来说，会比较少一些。