肥厚型梗阻性心肌病主要的治疗原则是控制原发病，减轻 并发症。当应肥厚型梗阻性心肌病发作，引起心肌收缩力下降时，建议口服洋地黄、β受体兴奋剂治疗，后期再联合能减轻心脏负荷药物治疗，例如 硝酸甘油。如果因该病引起 心律失常，建议口服能控制心律失常的药物治疗，例如β受体阻滞剂、钙拮抗剂，能使心肌收缩力减弱，减轻流出道梗阻，减少心肌的耗氧量。用药前应先咨询，禁止私自用药。